高樹鄉於清朝時代,隸屬鳳山縣。日據初期先隸屬阿猴廳,港西上里高樹下庄,後改隸高雄州屏東郡,分東振新區及加蚋埔區。民國九年,兩區合併為高樹庄。民國三十四年台灣光復,隸屬高雄縣屏東區,民國三十九年,行政區域調整,改隸於屏東縣。
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